检索结果相关分组
- 茶树‘紫娟’肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)克隆及序列分析
- 作者： 陈林波 宋维希 李晓霞 夏丽飞 周萌 梁名志 焉文光 来源：西北农业学报 年份：2016 文献类型 ：期刊 关键词： 序列分析 茶树 肉桂酰辅酶A还原酶 基因克隆
- 描述：末端扩增技术,分别扩增出5′端和3′端目的片段,测序后进行拼接获得茶树肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)cDNA全长序列,并进行序列分析。结果表明:克隆的茶树CsCCR基因cDNA全长1 259bp
- 基于RNA-Seq技术的“紫娟”茶树转录组分析
- 作者： 陈林波 夏丽飞 周萌 宋维希 李晓霞 焉文光 梁名志 来源：分子植物育种 年份：2015 文献类型 ：期刊 关键词： SSR RNA 茶树 转录组测序 Seq
- 描述：本研究基于RNA-seq技术对"紫娟"茶树芽、第二叶、开面叶、成熟叶四个时期的转录组进行测序以及生物信息学相关分析。研究结果表明,经组装分析获得268 172条transcript,进一步处理transcript获得206 210条Unigene,将获得的Unigene与Nr、SWISS-PROT、Tr EMBL、Cdd、pfam和KOG库进行blast,有19 379个Unigene被注释上25种KOG分类,注释到KEGG的Unigene个数为13 608,涉及的pathway有302个。SSR查找发现
- 云南大茶树遗传多样性的EST-SSR分析
- 作者： 周萌 李友勇 孙雪梅 王家金 谢瑾 成浩 汪云刚 刘本英 来源：第十五届中国科协年会 年份：2013 文献类型 ：会议论文 关键词： SSR 亲缘关系 遗传多样性 EST 茶树
- 描述：应用EST-SSR标记技术对云南省不同区域采集的39份古茶树资源进行了遗传多样性和亲缘关系研究.结果表明：43对EST-SSR引物共扩增出121条多态性谱带,有效等位基因变异占比重的73.88％.多态性信息量PIC值在0.049～0.737之间,平均为0.469.基因多样性指数平均值为0.533, Shannon指数平均值为0.812,均高于0.5.遗传相似系数在0.414～0.907之间,平均值为0.653,显示云南大茶树的遗传基础相对比较宽,具有较高的遗传多样性水平.SSR聚类分析表明,大茶树的遗传距
- 云南大茶树遗传多样性的EST-SSR分析
- 作者： 周萌 李友勇 孙雪梅 王家金 谢瑾 成浩 汪云刚 刘本英 来源：第十五届中国科协年会第20分会场：科技创新与茶产业发展论坛 年份：2013 文献类型 ：会议论文 关键词： SSR 亲缘关系 遗传多样性 EST 茶树
- 描述：应用EST-SSR标记技术对云南省不同区域采集的39份古茶树资源进行了遗传多样性和亲缘关系研究。结果表明:43对EST-SSR引物共扩增出121条多态性谱带,有效等位基因变异占比重的73.88%。多态性信息量PIC值在0.049～0.737之间,平均为0.469。基因多样性指数平均值为0.533,Shannon指数平均值为0.812,均高于0.5。遗传相似系数在0.414～0.907之间,平均值为
- 基于RNA-Seq技术的茶树花转录组分析
- 作者： 夏丽飞 朱兴正 梁名志 马伟 宋维希 田易萍 周萌 陈林波 来源：西南农业学报 年份：2016 文献类型 ：期刊 关键词： 不育基因 茶树 转录组测序 分子标记
- 描述：本研究利用RNA-seq技术对父本、母本、子代不育茶树花三个样本花的转录组进行测定,经组装分析获得403 469条高质量的Unigenes。将获得的Unigenes与SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM、NR和KOG库进行blast,共注释到307 291条Unigenes。KOG功能分类显示,有23 739个Unigenes被分为25类。KEGG通路分析表明,共识别出26 967个Unigenes涉及的pathway有328个。SSR查找发现,从403 469个Unigenes中找到46