安徽农业大学茶文化特色库
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基于RNA-Seq技术的茶树花转录组分析
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作者：
夏丽飞 朱兴正 梁名志 马伟 宋维希 田易萍 周萌 陈林波 来源：西南农业学报 年份：2016 文献类型 ：期刊 关键词： 不育基因 茶树 转录组测序 分子标记
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描述：本研究利用RNA-seq技术对父本、母本、子代不育茶树花三个样本花的转录组进行测定,经组装分析获得403 469条高质量的Unigenes。将获得的Unigenes与SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM、NR和KOG库进行blast,共注释到307 291条Unigenes。KOG功能分类显示,有23 739个Unigenes被分为25类。KEGG通路分析表明,共识别出26 967个Unigenes涉及的pathway有328个。SSR查找发现,从403 469个Unigenes中找到46
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基于转录组测序对茶树GST基因表达的研究
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作者：
张亚真 韦康 王丽鸳 成浩 来源：茶叶科学 年份：2016 文献类型 ：期刊 关键词： 谷胱甘肽转移酶 表达分析 茶树 转录组测序
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描述：谷胱甘肽转移酶(Glutathione S-transferases,GSTs)在植物体内普遍存在,是一类具有多种生物学功能的超家族蛋白酶。本研究通过对中黄2号、龙井43在正常光照和遮荫处理下的转录组测序,筛选获得了49个Cs GSTs基因家族成员,并对其中19个在芽叶中表达量较高的Cs GSTs基因进行了序列分析和聚类分析。另外对表达量较高的8个候选基因进行荧光定量表达分析,研究它们在龙井43不同叶位中的表达模式。结果表明这些Cs GSTs基因在一芽一叶到第六叶中均有表达,但各自呈现出不同的变化规律。C
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基于RNA-Seq技术的“紫娟”茶树转录组分析
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作者：
陈林波 夏丽飞 周萌 宋维希 李晓霞 焉文光 梁名志 来源：分子植物育种 年份：2015 文献类型 ：期刊 关键词： SSR RNA 茶树 转录组测序 Seq
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描述：本研究基于RNA-seq技术对"紫娟"茶树芽、第二叶、开面叶、成熟叶四个时期的转录组进行测序以及生物信息学相关分析。研究结果表明,经组装分析获得268 172条transcript,进一步处理transcript获得206 210条Unigene,将获得的Unigene与Nr、SWISS-PROT、Tr EMBL、Cdd、pfam和KOG库进行blast,有19 379个Unigene被注释上25种KOG分类,注释到KEGG的Unigene个数为13 608,涉及的pathway有302个。SSR查找发现
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基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究
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作者：
王丽鸳 来源：中国农业科学院 年份：2011 文献类型 ：学位论文 关键词： 生物信息学 EST 茶树 转录组测序 分子标记
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描述：应用研究,而且通过高通量RNA-seq获得大量茶树花的转录组序列,并以这些转录组序列为基础进行茶树SSR分子标记的大规模发掘,主要研究结果如下:(1)对NCBI网上公开的12,757条茶树ESTs序列
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‘白鸡冠’茶树响应光调控的基因差异及理化特征分析
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作者：
吴全金 来源：福建农林大学 年份：2015 文献类型 ：学位论文 关键词： 光照敏感型 白化 叶绿素缺失 叶绿体超微结构 茶树 差异基因表达谱 转录组测序
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描述：新梢白化茶树是一种珍稀的种质资源,其叶色变化和特异性成分的机理成为茶叶科研的热点和难点。‘白鸡冠’作为一种可稳定遗传的白化芽叶茶树,是茶树育种的良好材料,对其生理生化和表达调控进行研究,有助于了解茶树体内的代谢变化及遗传变异,因而具有较高的研究价值与实际意义。本研究以武夷名丛‘白鸡冠’茶树为材料,从生理、生化和转录水平进行响应光调控及其叶色形成机理的研究。首先通过光照和温度试验,明确‘白鸡冠’属于光照敏感型白化类型。应用新一代高通量测序技术,构建‘白鸡冠’茶树转录组和差异基因表达谱(DGE),对差异表达基