基于RNA-Seq技术的茶树花转录组分析

【类型】期刊

【基金项目】国家自然科学基金项目(31460216)；云南省重点专项(2013bb006)；云南省人才培养计划(2015hb105)；茶树生物学与资源利用国家重点实验室开放基金(skltof20150105)

【作者】夏丽飞 朱兴正 梁名志 马伟 宋维希 田易萍 周萌 陈林波 

【关键词】 不育基因 茶树 转录组测序 分子标记

【刊名】西南农业学报

【出版日期】2016-01-01

【ISSN】1001-4829

【页码】2058-2062

【期号】第9期

【作者单位】云南省农业科学院茶叶研究所/云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心

【卷号】vol.29

【摘要】本研究利用RNA-seq技术对父本、母本、子代不育茶树花三个样本花的转录组进行测定,经组装分析获得403 469条高质量的Unigenes。将获得的Unigenes与SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM、NR和KOG库进行blast,共注释到307 291条Unigenes。KOG功能分类显示,有23 739个Unigenes被分为25类。KEGG通路分析表明,共识别出26 967个Unigenes涉及的pathway有328个。SSR查找发现,从403 469个Unigenes中找到46

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