安徽农业大学茶文化特色库
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基于RNA-Seq技术的茶树花转录组分析
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作者:
夏丽飞 朱兴正 梁名志 马伟 宋维希 田易萍 周萌 陈林波 来源:西南农业学报 年份:2016 文献类型 :期刊 关键词: 不育基因 茶树 转录组测序 分子标记
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描述:本研究利用RNA-seq技术对父本、母本、子代不育茶树花三个样本花的转录组进行测定,经组装分析获得403 469条高质量的Unigenes。将获得的Unigenes与SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM、NR和KOG库进行blast,共注释到307 291条Unigenes。KOG功能分类显示,有23 739个Unigenes被分为25类。KEGG通路分析表明,共识别出26 967个Unigenes涉及的pathway有328个。SSR查找发现,从403 469个Unigenes中找到46
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基于数字基因表达谱分析的茶树花不育基因挖掘
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作者:
陈林波 夏丽飞 田易萍 李梅 宋维希 梁名志 江昌俊 来源:作物学报 年份:2016 文献类型 :期刊 关键词: 差异表达基因 不育基因 基因表达谱 茶树花
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描述:茶树是重要的叶用经济作物,但是茶树每年都要开花结实,消耗大量的养分,导致茶树鲜叶产量减少和品质降低。了解茶树的不育机制将有助于茶树不育品种的分子遗传改良。本研究以福鼎大白茶(父本)、佛香2号(母本)以及他们的杂交后代(不育)茶树花为材料,利用数字基因表达谱技术对3个茶树花的c DNA文库进行差异基因表达谱分析。筛选出在父本花与子代不育花、母本花与子代不育花共有而在父本花与母本花没有的差异表达基因1219条。GO功能显著性分析表明,代谢过程、催化活性、水解酶活性表现为富集;KEGG代谢分析表明,差异表达基因