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- 茶树EST-SNP的挖掘及其CAPS标记的转化
- 作者：暂无 来源：第七届海峡两岸茶业学术研讨会 年份：2012 文献类型 ：会议论文 关键词： SNP EST 茶树 CAPS
- 描述：从公共数据库中下载茶树EST序列，使用生物信息学方法挖掘候选SNPs；在候选SNPs两侧设计引物进行PCR扩增，对扩增产物双向测序进行验证；对确证的SNPs进行限制性内切酶识别位点分析，筛选出引起酶切位点改变的SNPs；在茶树基因组DNA中进行扩增，并使用相应的酶对扩增产物进行酶切，将SNPs转化为CAPS标记。结果，从EST序列中共发掘到818个候选SNPs；设计合成了123对引物，其中48对引物的PCR产物测序成功，共确证了201个SNPs；最终，将39个SNPs转化为CAPS标记。
- 基于EST的茶树分子生物学研究
- 作者： 冯素萍 刘超 徐桢贞 来源：福建茶叶 年份：2016 文献类型 ：期刊 关键词： 茶树分子 EST 生物学 茶树
- 描述：本文通过对茶树40对引物的EST序列设计,研究茶树分子生物学EST-SSR引物的开发与通用性,并挑选其中多态性和稳定性较好的13对引物,经研究分析得到其重复基序多超过18bp,且通用率高达46%以上,从而充分验证茶树分子EST序列引物的通用性特征。那么,下面将重点研究基于EST的茶树分子生物学特征。
- 基于EST-SSR的陕西茶树资源遗传多样性分析
- 作者： 陈熙 李佼 张羽 张颜青 徐凯明 来源：四川农业大学学报 年份：2016 文献类型 ：期刊 关键词： 多样性 SSR EST 茶树
- 描述：【目的】明确陕西省主要茶树种质资源的遗传多样性,为茶树育种提供依据。【方法】用6份有代表性的陕西茶树资源材料,从154对EST-SSR引物中筛选出39对扩增条带清晰、多态性高的引物,采用NTSYS-pc2.10e分析软件,相似系数选择DICE,用UPGMA进行聚类,对陕西省46份茶树资源进行遗传多样性研究。【结果】共检测到316个等位位点,每对引物可检测到3~16个等位位点,平均为8个;每个EST-SSR位点的遗传多态性信息含量在0.76~0.99之间,平均值为0.94。供试材料的遗传相似系数在0.00~
- 云南大茶树遗传多样性的EST-SSR分析
- 作者： 周萌 李友勇 孙雪梅 王家金 谢瑾 成浩 汪云刚 刘本英 来源：第十五届中国科协年会 年份：2013 文献类型 ：会议论文 关键词： SSR 亲缘关系 遗传多样性 EST 茶树
- 描述：应用EST-SSR标记技术对云南省不同区域采集的39份古茶树资源进行了遗传多样性和亲缘关系研究.结果表明：43对EST-SSR引物共扩增出121条多态性谱带,有效等位基因变异占比重的73.88％.多态性信息量PIC值在0.049～0.737之间,平均为0.469.基因多样性指数平均值为0.533, Shannon指数平均值为0.812,均高于0.5.遗传相似系数在0.414～0.907之间,平均值为0.653,显示云南大茶树的遗传基础相对比较宽,具有较高的遗传多样性水平.SSR聚类分析表明,大茶树的遗传距
- 云南大茶树遗传多样性的EST-SSR分析
- 作者： 周萌 李友勇 孙雪梅 王家金 谢瑾 成浩 汪云刚 刘本英 来源：第十五届中国科协年会第20分会场：科技创新与茶产业发展论坛 年份：2013 文献类型 ：会议论文 关键词： SSR 亲缘关系 遗传多样性 EST 茶树
- 描述：应用EST-SSR标记技术对云南省不同区域采集的39份古茶树资源进行了遗传多样性和亲缘关系研究。结果表明:43对EST-SSR引物共扩增出121条多态性谱带,有效等位基因变异占比重的73.88%。多态性信息量PIC值在0.049～0.737之间,平均为0.469。基因多样性指数平均值为0.533,Shannon指数平均值为0.812,均高于0.5。遗传相似系数在0.414～0.907之间,平均值为
- 茶树基因克隆、遗传转化研究进展及EST在茶树功能基因研究中的应用前景
- 作者： 赵丽萍 陈亮 高其康 来源：中国茶叶学会第三届海峡两岸茶叶学术研讨会 年份：2003 文献类型 ：会议论文 关键词： 遗传转化 EST 功能基因 茶树 基因克隆
- 描述：本文综述了茶树功能基因克隆、遗传转化研究的最新进展，并对基于植物EST研究茶树功能基因的前景进行展望，以期为茶树分子生物学研究服务。
- 利用EST-SSR基因分型研究分子标记与茶树表型性状的关联性
- 作者： 姚明哲 乔婷婷 马春雷 金基强 陈亮 杨亚军 来源：2009年中国茶叶科技创新与产业发展学术研讨会 年份：2009 文献类型 ：会议论文 关键词： SSR 表型性状 EST 关联分析 茶树
- 描述：通过EST-SSR标记对112份茶树资源材料进行基因分型,开展了分子标记与新梢一芽二叶长(BL)、一芽二叶百芽重(BW)、叶长长度(LL)、叶片宽度(LW)、咖啡碱含量(CAF)、氨基酸含量(AA)和茶多酚含量(TP)共7个茶树表型性状关联的初步分析。结果表明,在不考虑位点间的连锁不平衡(LD)和供试群体的结构(SA)时,利用ANOVA方法可检测到三个EST-SSR位点185、121和153与五个表型性状显著相关,其中标记185同时与4个表型性状BL、BW、LL和LW显著相关,标记121同时与3个表型性状
- 浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析
- 作者： 乔婷婷 马春雷 周炎花 姚明哲 陈亮 来源：2009年中国茶叶科技创新与产业发展学术研讨会 年份：2009 文献类型 ：会议论文 关键词： SSR 遗传多样性 EST 茶树 遗传结构
- 描述：采用茶树幼根EST-SSR引物对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示36对引物均表现出多态性,多态性位点百分率为100%;共检测到128个等位位点,平均每对引物3.6个;每对引物可鉴定的基因型在2-13个之间,平均4.7个。供试材料多态性信息量(PIC)变化范围在0.02-0.85之间,平均值为0.47;扩增位点的观测杂合度平均为0.52,期望杂合度平均为0.51。地方品种的遗传多样性水平略高于选育品种。不同地方群体资源多态性信息量在0.27-0.40之间,举岩群体的多样性最