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福建部分茶树品种SSR遗传差异分析与指纹图谱建立
作者: 王让剑 杨军 孔祥瑞 郭吉春  来源:第十六届中国科协年会——分12茶学青年科学家论坛 年份:2014 文献类型 :会议论文 关键词: SSR  品种  茶树  遗传差异  指纹图谱 
描述:以课题组选育的10个茶树品种及福建5个参照品种为材料,利用SSR分子标记进行遗传差异分析并建立分子指纹图谱,旨在进一步明确这些品种相互之间的遗传差异,为开展茶树良种鉴定及知识产权保护提供参考。实验结果表明,筛选出的6对核心引物具有较高的多态性;不同核心引物之间的Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)的差异随参试材料数目的增加而减小;10个自育品种遗传多样性水平与全部15个
云南大茶树遗传多样性的EST-SSR分析
作者: 周萌 李友勇 孙雪梅 王家金 谢瑾 成浩 汪云刚 刘本英  来源:第十五届中国科协年会 年份:2013 文献类型 :会议论文 关键词: SSR  亲缘关系  遗传多样性  EST  茶树 
描述:应用EST-SSR标记技术对云南省不同区域采集的39份古茶树资源进行了遗传多样性和亲缘关系研究.结果表明:43对EST-SSR引物共扩增出121条多态性谱带,有效等位基因变异占比重的73.88%.多态性信息量PIC值在0.049~0.737之间,平均为0.469.基因多样性指数平均值为0.533, Shannon指数平均值为0.812,均高于0.5.遗传相似系数在0.414~0.907之间,平均值为0.653,显示云南大茶树的遗传基础相对比较宽,具有较高的遗传多样性水平.SSR聚类分析表明,大茶树的遗传距
云南大茶树遗传多样性的EST-SSR分析
作者: 周萌 李友勇 孙雪梅 王家金 谢瑾 成浩 汪云刚 刘本英  来源:第十五届中国科协年会第20分会场:科技创新与茶产业发展论坛 年份:2013 文献类型 :会议论文 关键词: SSR  亲缘关系  遗传多样性  EST  茶树 
描述:应用EST-SSR标记技术对云南省不同区域采集的39份古茶树资源进行了遗传多样性和亲缘关系研究。结果表明:43对EST-SSR引物共扩增出121条多态性谱带,有效等位基因变异占比重的73.88%。多态性信息量PIC值在0.049~0.737之间,平均为0.469。基因多样性指数平均值为0.533,Shannon指数平均值为0.812,均高于0.5。遗传相似系数在0.414~0.907之间,平均值为
84个茶树品种遗传多样性及亲缘关系的SSR分析
作者: 董丽娟 王旭 段继华 张曙光  来源:第六届海峡两岸茶业学术研讨会 年份:2010 文献类型 :会议论文 关键词: SSR  亲缘关系  遗传多样性  品种  茶树 
描述:利用33对多态性SSR引物对84个茶树品种进行了亲缘关系和遗传多样性分析。结果表明:33对引物在供试品种中共检测到94个等位位点,每个引物2~4个,平均2.85个。引物多态性信息含量(PIC)在0.20~0.79之间,平均值为0.56。可观测等位位点数Na最多9个,最少3个,平均4.79个;杂合度观测值(H_o)在0.08~0.97之间,平均0.53;杂合度期望值(H_e)大小在0.14~0.86
湖南省主要茶树品种分子指纹图谱的构建
作者: 杨阳 刘振 赵洋 杨培迪  来源:2009年中国茶叶科技创新与产业发展学术研讨会 年份:2009 文献类型 :会议论文 关键词: 茶树品种  特异性指数  SSR  分子指纹图谱  湖南 
描述:。17对SSR引物共检测出41个等位位点,每个引物检测到的等位位点变化范围为2~3个,平均2.41个。根据茶树SSR标记带型特点,将扩增得到的1、0数据进行了基因型转换,分别用1、2、3、4……N来代表
利用EST-SSR基因分型研究分子标记与茶树表型性状的关联性
作者: 姚明哲 乔婷婷 马春雷 金基强 陈亮 杨亚军  来源:2009年中国茶叶科技创新与产业发展学术研讨会 年份:2009 文献类型 :会议论文 关键词: SSR  表型性状  EST  关联分析  茶树 
描述:通过EST-SSR标记对112份茶树资源材料进行基因分型,开展了分子标记与新梢一芽二叶长(BL)、一芽二叶百芽重(BW)、叶长长度(LL)、叶片宽度(LW)、咖啡碱含量(CAF)、氨基酸含量(AA)和茶多酚含量(TP)共7个茶树表型性状关联的初步分析。结果表明,在不考虑位点间的连锁不平衡(LD)和供试群体的结构(SA)时,利用ANOVA方法可检测到三个EST-SSR位点185、121和153与五个表型性状显著相关,其中标记185同时与4个表型性状BL、BW、LL和LW显著相关,标记121同时与3个表型性状
浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析
作者: 乔婷婷 马春雷 周炎花 姚明哲 陈亮  来源:2009年中国茶叶科技创新与产业发展学术研讨会 年份:2009 文献类型 :会议论文 关键词: SSR  遗传多样性  EST  茶树  遗传结构 
描述:采用茶树幼根EST-SSR引物对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示36对引物均表现出多态性,多态性位点百分率为100%;共检测到128个等位位点,平均每对引物3.6个;每对引物可鉴定的基因型在2-13个之间,平均4.7个。供试材料多态性信息量(PIC)变化范围在0.02-0.85之间,平均值为0.47;扩增位点的观测杂合度平均为0.52,期望杂合度平均为0.51。地方品种的遗传多样性水平略高于选育品种。不同地方群体资源多态性信息量在0.27-0.40之间,举岩群体的多样性最
黔南60份茶树种质资源遗传多样性的SSR分析
作者: 张明泽 姚玉仙 陈世军  来源:西北植物学报 年份:2016 文献类型 :期刊 关键词: 黔南  SSR  遗传多样性    种质资源 
描述:为探索黔南野生茶树种质资源的遗传多样性,利用SSR分子标记技术,对黔南60份茶树资源进行了DNA遗传多样性分析。结果表明:15对引物均显示多态性,基因多态性百分率为98.64%。15对SSR引物共扩增出147个观测等位基因和73.778 6个有效等位基因,平均每个引物扩增9.8个观测等位基因,4.918 6个有效等位基因。15个通用位点共产生280种基因型,平均每个位点18.7种基因型。遗传多态信息量变异范围为0.123 9~0.926 8,平均0.572 5,平均观测杂合度、平均期望杂合度和平均Shan
基于SSR标记贵州古茶树资源的遗传多样性分析及指纹图谱构建
作者: 郭燕 刘声传 曹雨 赵华富 魏杰 鄢东海 周富裕  来源:西南农业学报 年份:2016 文献类型 :期刊 关键词: 古茶树资源  SSR  遗传多样性  贵州  指纹图谱 
描述:为了贵州古茶树资源的有效保护和充分利用提供理论依据,采用EST-SSR标记对40份贵州古茶树资源进行了遗传多样性分析和分子指纹鉴定。结果表明:20个SSR标记在40份资源中共检测到76个等位基因,平均每个标记3.8个,PIC和Shannon信息指数平均值分别为0.462和0.936,多态性适中。76个等位基因在参试古茶树资源中的出现频率差异较大,变异范围为1.32%~89.74%。参试材料的Nei’s遗传距离(D)为0.075~0.875,当D≈0.160时,40份古茶树资源可聚为6类,包括3个单独聚类和
基于RNA-Seq技术的“紫娟”茶树转录组分析
作者: 陈林波 夏丽飞 周萌 宋维希 李晓霞 焉文光 梁名志  来源:分子植物育种 年份:2015 文献类型 :期刊 关键词: SSR  RNA  茶树  转录组测序  Seq 
描述:本研究基于RNA-seq技术对"紫娟"茶树芽、第二叶、开面叶、成熟叶四个时期的转录组进行测序以及生物信息学相关分析。研究结果表明,经组装分析获得268 172条transcript,进一步处理transcript获得206 210条Unigene,将获得的Unigene与Nr、SWISS-PROT、Tr EMBL、Cdd、pfam和KOG库进行blast,有19 379个Unigene被注释上25种KOG分类,注释到KEGG的Unigene个数为13 608,涉及的pathway有302个。SSR查找发现
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