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基于RNA-Seq技术的“紫娟”茶树转录组分析
作者: 陈林波 夏丽飞 周萌 宋维希 李晓霞 焉文光 梁名志  来源:分子植物育种 年份:2015 文献类型 :期刊 关键词: SSR  RNA  茶树  转录组测序  Seq 
描述:本研究基于RNA-seq技术对"紫娟"茶树芽、第二叶、开面叶、成熟叶四个时期的转录组进行测序以及生物信息学相关分析。研究结果表明,经组装分析获得268 172条transcript,进一步处理transcript获得206 210条Unigene,将获得的Unigene与Nr、SWISS-PROT、Tr EMBL、Cdd、pfam和KOG库进行blast,有19 379个Unigene被注释上25种KOG分类,注释到KEGG的Unigene个数为13 608,涉及的pathway有302个。SSR查找发现
茶树部分种质资源的遗传多样性分析与抗旱性评价
作者: 黎钊  来源:西北农林科技大学 年份:2015 文献类型 :学位论文 关键词: SSR  叶片解剖结构  种质  抗旱  茶树 
描述:中国是茶的原产地,有丰富的种质资源。茶对水的需求较高,一般降水要求在1000mm左右。但是由于降水不均,加之近几年全球变暖导致的极端天气,大多数茶区并不总是适宜茶树生长的,干旱胁迫下会影响茶叶的质量及茶区的产量,因此需要提高茶树的抗旱性以减少干旱对茶树的影响。充分利用现有种质资源进行抗旱育种是解决这些问题的有效手段。正确评价茶树种质的遗传多样性和抗旱性是有效保护和利用茶树品种进行茶树抗旱育种的前提条件,本研究利用10对SSR引物对来自4大茶区的85个茶树种质资源进行遗传多态性和亲缘关系分析。10对SSR引
千家寨不同海拔野生茶树的EST-SSR遗传多样性研究
作者: 黄晓霞 唐探 姜永雷 冯程程 程小毛  来源:茶叶科学 年份:2015 文献类型 :期刊 关键词: 野生茶树  SSR  遗传多样性  海拔梯度  EST  遗传分化 
描述:利用5对EST-SSR引物对千家寨内7个海拔梯度的野生茶树居群进行遗传多样性和遗传结构的研究。在物种水平上,Shannon信息指数(I)和Nei基因多样性(He)分别为1.33和0.66,表现出很高的遗传多样性;千家寨不同海拔梯度上野生茶树居群的遗传多样性有差异,且随着海拔梯度的递增,居群的遗传多样性呈现出低—高—低的分布,并在海拔2 100 m处达到最大值;野生茶树居群间的基因流(Nm)为1.84,群体分化系数(Fst)为0.12,且基于AMOVA软件分析结果显示有16.32%的变异发生在居群间,表明野
镇江及苏州地区茶树资源表型性状和SSR标记的遗传多样性分析
作者: 徐礼羿 王丽鸳 虞德飞 朱永良 成浩  来源:中国茶叶 年份:2015 文献类型 :期刊 关键词: SSR  简单重复序列  微卫星  遗传变异  表型性状  遗传多样性  苏州地区  茶树资源  直观简便  茶树种质资源 
描述:简便地反映出群体的遗传变异,因此常用于植物的多样性研究上。微卫星,也被称为简单重复序列(SSRs),是指在基因组中多次重复的DNA片段(通常1~6bp)构成的特定序列。这样的重复序列广泛分布在整个真核基因组中。通过
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