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基于表达序列标签(EST)策略的茶树分子生物学研究
作者: 陈亮 赵丽萍 马春雷 张亚丽  来源:2007年全国茶业科技学术研讨会 年份:2007 文献类型 :会议论文 关键词: 分子生物学  表达序列标签  基因表达谱  茶树  cDNA文库  基因克隆 
描述:表达序列标签是在人类基因组计划实施过程中,由美国国立卫生研究院生物学家Venter提出的发现基因的新战略。EST技术已被广泛应用于新基因的克隆、组织特异性基因表达谱分析以及基因组序列的功能注释等许多研究领域,它已成为大规模获取功能基因的一种最为快捷和有效的研究手段。茶树是一种重要的木本经济植物,其分子生物学研究起步较晚,大大滞后于禾谷类与许多其他木本植物。最近,基于cDNA文库和EST测序分析技术的茶树分子生物学研究,包括基因表达谱特征分析、cDNA芯片建立与应用、EST-SSR/STR标记开发与应用、次
基于表达序列标签(EST)策略的茶树分子生物学研究
作者: 陈亮 赵丽萍 马春雷 张亚丽  来源:全国茶业科技学术研讨会 年份:2007 文献类型 :会议论文 关键词: 表达序列标签  RACE  芯片  基因表达谱  茶树  cDNA文库  基因克隆 
描述:表达序列标签是在人类基因组计划实施过程中,由美国国立卫生研究院生物学家Venter提出的发现基因的新战略。EST技术已被广泛应用于新基因的克隆、组织特异性基因表达谱分析以及基因组序列的功能注释等许多研究领域,它已成为大规模获取功能基因的一种最为快捷和有效的研究手段。茶树是一种重要的木本经济植物,其分子生物学研究起步较晚,大大滞后于禾谷类与许多其他木本植物。最近,基于cDNA文库和EST测序分析技术的茶树分子生物学研究,包括基因表达谱特征分析、cDNA芯片建立与应用、EST-SSR/STR标记开发与应用、次
茶树叶片ESTs序列及其功能基因表达谱特征分析
作者: 赵丽萍 陈亮 高其康  来源:中国茶叶学会成立四十周年庆祝大会暨2004年学术年会 年份:2004 文献类型 :会议论文
描述:在建立龙井43春季叶片cDNA文库后,进行了高通量的cDNA克隆测序,共获1684个高质量的表达序列标签(ESTs),并与NCBI的非冗余核酸与蛋白质数据库进行BlastN、BlastX比对,分别表明607个和1008个ESTs为已知功能或具推测功能基因,占总数的63.8%和28.7%。为了对茶树叶片基因表达谱有更加深入的了解,按照拟南芥功能基因分类标准,把BlastX比对结果中具有已知功能或推测功能的1008个ESTs,根据所参与的细胞过程将其分为12大类,即代谢相关基因占8.3%、能量相关基因占26.
cDNA文库建立与ESTs测序分析:一个发现和鉴定茶树功能基因的高效快速新途径
作者: 陈亮 赵丽萍 高其康  来源:中国茶叶学会第三届全国青年茶学学术研讨会 年份:2003 文献类型 :会议论文 关键词: 茶树种植  遗传育种  基因文库  龙井茶树 
描述:本文以Trizol-步法从龙井43春茶新梢中提取总RNA,分离纯化富含PolyA的mRNA,反转录合成双链cDNA,以λTripEX2为载体,构建了龙井43新梢cDNA文库。原始文库的滴度为6.8×105pfu,ml,总克隆数为3.5×105个,重组率为98.05%,扩增后文库总滴度为7.2×109pfu/ml。对随机挑取的噬菌斑进行PCR鉴定,表明插入片段大多分布在0.5-2.0kb之间,绝大部分在1.0-1.5kb左右。文库质量鉴定结果表明,构建的茶树新梢cDNA文库具有较好的库容量、较高的重组率以及
茶树新梢不同叶片中β-葡萄糖苷酶和β-樱草糖苷酶基因表达的实时定量PCR分析
作者: 赵丽萍 陈亮 王新超 姚明哲  来源:长三角现代植物生物学与农业专题论坛论文集 年份:2005 文献类型 :会议论文 关键词: 实时定量PCR  茶树  樱草糖苷酶  葡萄糖苷酶 
描述:在建立了茶树基因表达的绝对定量实时PCR检测方法后,检测了龙井43新梢不同部位叶片中的β-葡萄糖苷酶和β-樱草糖苷酶基因的表达情况,结果表明?葡萄糖苷酶在一芽五叶新梢的第四叶中表达活性最高,为2.86E+08拷贝/μL,其次分别为第三叶>第五叶>第二叶>一芽一叶。而β-樱草糖苷酶在第二叶中拷贝数最高,为4.02E+06拷贝/μL,其次分别为:第三叶>第四叶>一芽一叶>第五叶。与茶叶香气密切相关两个基因在茶树不同部位的叶片中表达量和表达类型存在明显差异。本实验建立的实时荧光定量PCR可有效地用于茶树基因表达
利用基因芯片筛选茶树芽叶紫化相关基因
作者: 马春雷 姚明哲 王新超 金基强 陈亮  来源:第六届海峡两岸茶业学术研讨会 年份:2010 文献类型 :会议论文 关键词: 差异表达基因  基因芯片  茶树  紫芽 
描述:采用基因芯片技术对龙井群体中紫芽资源和绿芽资源进行分析,探索茶树紫化相关的差异表达基因。结果检测到差异表达基因43个,其中上调表达基因17个,下调表达基因26个。以基因芯片中紫芽资源上调基因TC0002e03和下调基因TL016D09、TL011D06,及不变基因TL022H08、TL024B05为材料,用实时荧光定量方法验证基因芯片的结果,二者完全相符。根据基因芯片的实验结果,采用数据库查询方式
茶树基因芯片的研制和初步应用
作者: 赵丽萍 高其康 陈亮 王新超 姚明哲  来源:第四届海峡两岸茶业学术研讨会 年份:2006 文献类型 :会议论文 关键词: 定量PCR  基因表达谱  茶树  cDNA芯片 
描述:利用EST计划获得的1680个基因片段,制备了国内外首张茶树cDNA芯片, 芯片上每个基因设置一个重复,共含有6912个点,其中6720个靶基因,160个阳性对照,32个阴性对照。4×4矩阵点制,共两个区域,每个区域的芯片密度为1037点/cm2,每张芯片可进行两次杂交。用3个茶多酚含量有差异的品种与芯片进行了杂交, 获得了不同品种的基因表达谱及表达差异的基因;选取其中2个与茶叶香气密切相关的基因,采用荧光定量PCR的方法进行了验证,基因表达变化趋势与芯片检测结果一致,验证了cDNA芯片杂交结果的可靠性。
浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析
作者: 乔婷婷 马春雷 周炎花 姚明哲 陈亮  来源:第三届海峡两岸茶业博览会暨茶业国际高峰论坛 年份:2009 文献类型 :会议论文 关键词: genetic  Tea  diversity  SSR  EST  structure 
描述:采用茶树幼根EST-SSR引物对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性和遗传结构分析.结果显示36对引物均表现出多态性,多态性位点百分率为100%;共检测到128个等位位点,平均每对引物3.6个;每对引物可鉴定的基因型在2-13个之间,平均4.7个.供试材料多态性信息量(PIC)变化范围在0.02-0.85之间,平均值为0.47;扩增位点的观测杂合度平均为0.52,期望杂合度平均为0.51.地方品种的遗传多样性水平略高于选育品种.不同地方群体资源多态性信息量在0.27-0.40之间,举岩群体的多样性最
浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析
作者: 乔婷婷 马春雷 周炎花 姚明哲 陈亮  来源:2009茶叶科技创新与产业发展学术研讨会 年份:2009 文献类型 :会议论文
描述:采用茶树幼根EST-SSR 引物对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性 和遗传结构分析。结果显示36 对引物均表现出多态性,多态性位点百分率为100%; 共检测到128个等位位点,平均每对引物3.6个;每对引物可鉴定的基因型在2-13个 之间,平均4.7个。供试材料多态性信息量(PIC)变化范围在0.02-0.85 之间,平均值 为0.47;扩增位点的观测杂合度平均为0.52,期望杂合度平均为0.51。地方品种的遗 传多样性水平略高于选育品种。不同地方群体资源多态性信息量在0.27-0.40 之间,
浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析
作者: 乔婷婷 马春雷 周炎花 姚明哲 陈亮  来源:2009年中国茶叶科技创新与产业发展学术研讨会 年份:2009 文献类型 :会议论文 关键词: SSR  遗传多样性  EST  茶树  遗传结构 
描述:采用茶树幼根EST-SSR引物对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示36对引物均表现出多态性,多态性位点百分率为100%;共检测到128个等位位点,平均每对引物3.6个;每对引物可鉴定的基因型在2-13个之间,平均4.7个。供试材料多态性信息量(PIC)变化范围在0.02-0.85之间,平均值为0.47;扩增位点的观测杂合度平均为0.52,期望杂合度平均为0.51。地方品种的遗传多样性水平略高于选育品种。不同地方群体资源多态性信息量在0.27-0.40之间,举岩群体的多样性最
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