安徽农业大学茶文化特色库
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基于RNA-Seq技术的茶树花转录组分析
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作者:
夏丽飞 朱兴正 梁名志 马伟 宋维希 田易萍 周萌 陈林波 来源:西南农业学报 年份:2016 文献类型 :期刊 关键词: 不育基因 茶树 转录组测序 分子标记
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描述:本研究利用RNA-seq技术对父本、母本、子代不育茶树花三个样本花的转录组进行测定,经组装分析获得403 469条高质量的Unigenes。将获得的Unigenes与SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM、NR和KOG库进行blast,共注释到307 291条Unigenes。KOG功能分类显示,有23 739个Unigenes被分为25类。KEGG通路分析表明,共识别出26 967个Unigenes涉及的pathway有328个。SSR查找发现,从403 469个Unigenes中找到46