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基于RNA-Seq技术的“紫娟”茶树转录组分析
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作者：
陈林波 夏丽飞 周萌 宋维希 李晓霞 焉文光 梁名志 来源：分子植物育种 年份：2015 文献类型 ：期刊 关键词： SSR RNA 茶树 转录组测序 Seq
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描述：本研究基于RNA-seq技术对"紫娟"茶树芽、第二叶、开面叶、成熟叶四个时期的转录组进行测序以及生物信息学相关分析。研究结果表明,经组装分析获得268 172条transcript,进一步处理transcript获得206 210条Unigene,将获得的Unigene与Nr、SWISS-PROT、Tr EMBL、Cdd、pfam和KOG库进行blast,有19 379个Unigene被注释上25种KOG分类,注释到KEGG的Unigene个数为13 608,涉及的pathway有302个。SSR查找发现