安徽农业大学茶文化特色库
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茶树过氧化氢酶基因CsCAT1克隆与生物信息学分析
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作者:
王仲 赖钟雄 郭玉琼 来源:龙岩学院学报 年份:2016 文献类型 :期刊 关键词: CsCAT 铁观音茶树 过氧化氢酶 基因克隆
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描述:为了解茶树过氧化氢酶(CAT)基因的相关信息,以茶树叶片为原始材料,克隆获得茶树CsCAT基因全长,并进行生物信息学分析。结果表明:茶树CsCAT基因cDNA全长1682bp,完整的开放阅读框(ORF)长度为1479bp,共编码492个氨基酸。生物信息学分析显示:CAT蛋白分子量为56.81kD,理论等电点(pI)6.78,总平均疏水系数为-0.546,预测亚细胞定位于过氧化物酶体,为稳定的酸性亲水蛋白。茶树CAT氨基酸序列与棉花、毛果杨、胡麻的相似性分别为93%、92%、91%。
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茶树EGCG合成过程相关的Ankyrin基因的克隆与表达分析
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作者:
郑世仲 林玉玲 孙平 赖钟雄 林金科 来源:热带作物学报 年份:2016 文献类型 :期刊 关键词: 生物信息学 锚蛋白重复序列 EGCG 亚细胞定位 茶树
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描述:运用RACE技术,从茶树新品系“1005”嫩芽中克隆出Ankyrin基因全长c DNA(2 034 bp),5′UTR和3′UTR分别为353 bp和55 bp,编码541个氨基酸,命名为CS-Ankyrin。基因全长序列在线blast比对分析结果表明,该基因与葡萄、蓖麻、可可和杨树的Ankyrin序列的一致性分别为78%、78%、77%和77%。生物信息学分析显示,CS-Ankyrin锚蛋白重复序列是由5个ANK单元组成,该蛋白是定位在质膜上起作用的跨膜疏水蛋白,但疏水性较差;系统进化树分析表明,该基因
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铁观音茶树叶片总RNA提取方法研究
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作者:
赵姗姗 郭玉琼 潘一斌 王仲 赖钟雄 来源:龙岩学院学报 年份:2015 文献类型 :期刊 关键词: 茶树 申能博彩试剂盒与Tripure试剂结合法 总RNA提取 Tripure试剂法
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描述:铁观音茶树不同生育时期叶片为材料,采用Tripure试剂法、申能博彩试剂盒与Tripure试剂相结合的方法提取茶树叶片总RNA。结果表明,Tripure试剂法比结合法更适宜提取铁观音茶树RNA,该方法提取的RNA 28S、18S和5S rRNA条带清晰明亮;OD260/OD280值在1.7~2.0之间,说明该方法提取的RNA完整性和纯度好,可用于进行后续分子生物学实验。
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铁观音茶树RING型E3泛素连接酶基因克隆及其干旱胁迫下的表达分析
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作者:
常笑君 郭玉琼 王仲 赵姗姗 朱晨 林玉玲 赖钟雄 来源:福建农业学报 年份:2016 文献类型 :期刊 关键词: RING型E3泛素连接酶 干旱胁迫 qPCR 铁观音 基因克隆
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描述:以铁观音茶树为试材,对其中E3泛素连接酶基因进行克隆和生物信息学分析,并采用qPCR进行不同干旱条件下的定量表达分析。研究结果表明,该序列全长为1 138bp,开放阅读框(ORF)为810bp,编码