茶树EST-SSR标记的建立及其应用研究

【类型】学位论文

【作者】金基强 

【关键词】 SSR信息 通用性 资源分析 EST 标记建立 茶树

【学位授予单位】浙江大学

【学位年度】2006-01-01

【学位名称】硕士

【分类号】S571.102;|Q943.2

【导师姓名】崔海瑞

【摘要】利用现有生物数据库中的茶树EST资源,在了解茶树EST中SSR的信息的基础上首次建立了EST-SSR标记,同时对其在品种资源分析中的应用和相关物种中的通用性进行了探讨。主要结果如下: 明确了茶树EST中SSR的频率及特性。从NCBI公共数据库下载获得1989条茶树EST,去除其中的低质量的和冗余的序列,得到全长为734.54kb的1589条无冗余EST。共在这些序列中发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%。这些EST-SSR的平均长度为33.06bp,平均分布频率是

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