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茶树品种"福鼎大白茶"和"小雪芽"叶片基因转录组研究

日期:2012.01.01 点击数:6

【类型】会议论文

【会议录名称】第七届海峡两岸茶业学术研讨会论文集

【关键词】 unigene SSR GO 基因表达 COG 新梢白化 转录组

【会议名称】第七届海峡两岸茶业学术研讨会

【日期】2012-01-01

【摘要】以茶树品种"福鼎大白茶"和低温诱导型新梢白化茶树品种"小雪芽"叶片为材料,构建基因转录本;组装得到unigene 79797条,其中,基因序列长度在1K以上的有11644条,占unigene库总数的14.25%.SSR分析显示,共有6439条SSR,其中1-3个碱基的完美重复SSR占84.32%.基因表达丰度RPKM值显示,"小雪芽"表达上调的基因数为1821个,表达下调基因数为1779个.差异表达基因GO和COG分析显示,引起低温诱导型茶树新梢白化的可能遗传机理存在于蛋白质翻译后的修饰过程,从而导致酶活

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