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茶树SNP标记的开发与应用
作者: 张成才  来源:中国农业科学院 年份:2012 文献类型 :学位论文 关键词: 遗传多样性  dCAPS  EST  SNPs  茶树  CAPS 
描述:茶树原产于我国西南地区,由于自交不亲和以及长期的自然演化,形成了目前丰富的种质资源,为优良品种的选育提供了便利的条件。然而,茶树是多年生木本植物,树体大、童期长,传统的育种方法育种周期长。因此,为了缩短育种周期,分子标记辅助育种手段越来越受到育种者的关注。本研究从茶树EST数据库中发掘候选SNPs,在其两侧设计引物进行PCR扩增,对扩增产物直接测序,在茶树基因组中鉴定这些SNPs。然后,为了更加便捷而且低成本地鉴定SNPs,部分SNPs被转化为CAPS标记和dCAPS标记。最后,使用开发的SNPs标记,对
基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究
作者: 王丽鸳  来源:中国农业科学院 年份:2011 文献类型 :学位论文 关键词: 生物信息学  EST  茶树  转录组测序  分子标记 
描述:应用研究,而且通过高通量RNA-seq获得大量茶树花的转录组序列,并以这些转录组序列为基础进行茶树SSR分子标记的大规模发掘,主要研究结果如下:(1)对NCBI网上公开的12,757条茶树ESTs序列
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