安徽农业大学茶文化特色库
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茶树表达序列标签中的微卫星特征分析
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作者:
钱春仙 高俊 刘林 杨静 李成云 来源:西南农业学报 年份:2015 文献类型 :期刊 关键词: 微卫星 表达序列标签 茶树
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描述:从NCBI数据库中下载到50776条茶树表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列,利用Tandem Repeats Finder程序,对≧24 bp的微卫星(简单重复序列)进行系统分析。结果表明,在所分析的茶树EST序列中,搜索到长度大于或等于24 bp,基序匹配值大于80%的微卫星序列5299个,在这些微卫星中,单核甘酸的最多,数量达3283个,占SSR总数的61.96%,其次为2核甘酸微卫星序列,共1113个,占微卫星总数的21%。4核苷酸微卫星数量最少,仅39个,占